Curs Biofizica Moleculara 2003


Note de curs
   
Lecturi complementare



Subiecte examen
1.
Forta Electrostatica. Notiunea de cimp electrostatic
2.
Calculul lucrului mecanic in cimp electrostatic. Notiunea de potential.
3.
Distributii de sarcina. Aproximatii multipolare ale cimpului unei distributii de sarcina.
4.
Postulatele mecanicii cuantice.
5.
Nivele energetice, numere cuantice, orbitali atomici.
6.
Atomi cu mai multi electroni.
7.
Aproximatia Born-Oppenheimer.
8.
Orbitali moleculari.
9.
Geometrie si flexibilitate moleculara.
10.
Distributii moleculare de sarcina. Sarcini partiale de echilibru si induse.
11.
Interactii intre sarcini necompensate. Cristale ionice. Constanta dielectrica.
12.
Interactii dipolare. Legatura de hidrogen.
13.
Interactii slabe. Keesom, Debye, London, Van der Waals.
14.
Medii condensate. Potentialul de forta medie. Estimarea energiei de coeziune.
15.
Principiul I al TD. Entalpia. Calorimetrie.
16.
Principiul al II al TD. Ciclul Carnot. Notiunea de entropie.
17.
Energia libera si potentialul chimic.
18.
Potentiale termodinamice.
19.
Echilibrul termodinamic si tendinta spre echilibru in sistemele termodinamice.
20.
Ansamblul statistic. Distributia Boltzman si aplicatiile sale.
21.
Conditia de formare a mediilor condensate.
22.
Structura apei.
23.
Solutii ionice. Energia Born. Solubilitatea ionilor.
24.
pH-ul. Ecuatia Henderson-Hasselbach. Tampoane.
25.
Compusi hidrofili/hidrofobi. Efectul hidrofob.
26.
Compusi amfifili. Autosamblarea.
27.
Structura membranelor biologice.
28.
Fluxuri materiale in sistemele biologice. Fenomene de transport.
29.
Difuzia si electrodifuzia. Legile Fick
30.
Potentialul Nernst. Ecuatia Goldman-Hodgkin-Katz.
31.
Aminoacizi. Proprietati, clasificare, matrici de substitutie. Structura primara a proteinelor.
32.
Legatura peptidica. Parametrii ce caracterizeaza configuratia lantului principal si a lanturilor laterale.
33.
Structura spatiala locala a lantului polipeptidic. Structuri secundare si stabilizarea lor prin punti de hidrogen. Preferinte conformationale.
34.
Contactul spatial al aminoacizilor departati in secventa – hartile de distanta. Identificarea tipurilor de structuri secundare in hartile de distanta.
35.
Structura tertiara. Clase de impachetare, module functionale-cofactori.
36.
Stabilitatea structurii native. Principalele contributii la variatia energiei libere in procesul de pliere.